Ученые из Института биоорганической химии РАН разработали браузер VDJviz для обработки больших объемов информации, полученной в результате анализа последовательностей ДНК. Эта программа открывает новый толчок для изучения возможностей иммунитета.
В принципе, организм человека в состоянии самостоятельно бороться с различными враждебными факторами. Однако нередко иммунитет дает сбой — и в результате развиваются аллергии и другие аутоиммунные заболевания, появляются опухоли. Отчего это происходит, и пытаются понять ученые.
Программа была названа VDJviz от названия групп фрагментов генома, из которых формируются зрелые гены рецепторов В- и Т-клеток иммунной системы, а также антител: V — variable, D — diversity и J — joining. «Сложный процесс созревания таких генов, называемый V(D)J-рекомбинация, лежит в основе формирования адаптивного иммунитета — защитной системы организма, теоретически способной противостоять любому встречаемому патогену и предотвращать развитие опухолей», — сказал ученый и один из авторов статьи Иван Звягин.
В принципе, современная наука уже научилась получать немало данных — методы молекулярной биологии позволяют определять кодируюущие последовательности этих гипервариабельных рецепторов и иммуноглобулинов. И вот эффективно обрабатывать эти данные можно с помощью вновь созданной программы VDJviz.
«VDJviz оптимизирует работу исследователей и поможет в разработке и проверке новых гипотез о формировании и работе системы адаптивного иммунитета. Новые знания в этой области необходимы для разработки новых методов терапии болезней аутоиммунного и онкологического характера, а также аллергий», — подчеркивает Иван Звягин*.
